По природным условиям, в том числе по специфике флоры и фауны, в Азербайджане выделяются 4 области (карта 1).
Большой Кавказ отличается крутизной хребтов, контрастностью рельефа, наличием типичных высотных поясов (от полупустыни до вечных ледников), хорошо развитой речной сетью, сравнительно большими массивами низменных и горных лесов. В хозяйственном отношении освоено около половины общей площади, преимущественно предгорных и низкогорных районов.
Малый Кавказ (включая и Закавказское нагорье) характеризуется сглаженностью высотных поясов (кроме Муровдагского и Зангезурского хребтов), небольшой площадью лесов, континентальным и засушливым климатом, слаборазвитой речной сетью. Преобладают ксерофильные ассоциации растительности. Аридные массивы занимают большие площади. Естественные ландшафты претерпели большие изменения вследствие интенсивной хозяйственной деятельности человека.
Куринская (межгорная) равнина занимает около половины площади республики. Преобладают полупустыни. Климат сухой субтропический. Вдоль русел рек остались небольшие участки галерейных (тугайных) лесов. Около 60% территории занято сельскохозяйственными угодьями, пастбищами, населенными пунктами. В связи с нефте-газодобычей и транспортировкой углеводородов существенно возрос антропогенный пресс на экосистемы этой области.
Гирканская (Ленкоранская) область . В состав этого самого малого (около 5% площади республики) региона входят узкая низменность и Талышские горы. Густо развита речная сеть. Климат на низменности и в среднегорье влажный субтропический, на северо-западе и выше 1500 м умеренно-теплый с сухим летом и холодной зимой, небольшим количеством осадков (300-400 мм, против 1500-1700 мм в нижних поясах, 300-1000 мм на равнине). Естественная растительность до 1000 м лесная, выше - ксерофильная. Равнины и предгорья урбанизированы. Много плантаций субтропических и овощных культур.
Териофауна этих областей разнится. Прежде всего, следует указать на широко-распространенные в Азербайджане виды. Основу населения млекопитающих во всех регионах составляют 22 вида (в порядке плотности населения) - Pipistrellus pipistrellus, P.кuhlii, Mus musculus, Sylvaemus uralensis, S.fulvipectus, Myotis blythii, Eptesicus serotinus, Dryomys nitedula, Canis lupus, Arvicola terrestris, Microtus socialis, Vulpes vulpes, Canis aureus, Rattus norvegicus, Sus scrofa, Crocidura guldenstaedti, Rhinolophus hipposideros, Myotis mystacinus, Lepus europaeus, Cricetulus migratorius, Martes foina, Meles meles. Также широко распространены, но малочисленны Crocidura suaveolens, C.leucodon, Erinaceus concolor, Neomys schelkovnikovi, Plecotus auritus, Barbastella barbastellus, Nyctalus noctula, Hystrix leucura, Mustela nivalis, Rhinolophus ferrumequinum, Myotis emarginatus, Hypsugo savii, Lutra lutra. На равнинах и в предгорьях многочисленны песчанки и тушканчики.
Первое место по числу зарегистрированных видов занимает Малый Кавказ, где из 81 представителя только на его территории обнаружены 10: Rhinolophus euryale, Miniopterus schreibersii, Tadarida teniotis, Calomyscus urartensis, Meriones meridianus, M.vinogradovi, Terricola nazarovi, Otocolobus manul, Capra aegagrus, Ovis orientalis. Почти все они относятся к сухо- и теплолюбивым видам переднеазиатского происхождения. Для большей части терионаселения этого региона характерна ксерофильность.
На Большом Кавказе из 75 выявленных видов только на его территории найдены Myotis bechsteinii, Apodemus agrarius, Micromys minutus, Chionomys gud, Ch.roberti, Rupicapra rupicapra, Capra cylindricornis. Относятся эти животные к европейским лесным (первые три) и кавказским мезофильным комплексам. В целом на Большом Кавказе доминируют мезофилы.
В Куринской области отмечено 69 видов, большинство которых характерно и для окаймляющих горных массивов. Только здесь обитает джейран. Основу населения млекопитающих составляют сухолюбивые виды (нетопырь Куля, общественная полевка, песчанки, тушканчики и др.)
Для небольшой, но чрезвычайно биоразнообразной Ленкоранской области отмечено 64 вида, из которых 30 встречаются по всему Азербайджану, около 30 общие с одной-двумя другими регионами, и только здесь выявлены Crocidura caspicа, Sylvaemus hуrcanicus, Terricola schelkovnikovi. В лесных ландшафтах доминируют мезофилы, в аридном нагорье Талыша и северо-западной полупустыне - ксерофилы. Интересно, что общими для Малого Кавказа и Талыша были и есть Ellobius lutescens, Chionomys nivalis, исчезнувший Panthera tigris, единичные P.pardus.